Épargné par les destructions de la Première Guerre mondiale, cet édifice du XVIe siècle est l'un des plus anciens de notre territoire.
Dans notre région qui a terriblement été impactée par la guerre, le village de Magny-la-Fosse n'a pas échappé aux destructions. En effet, son château a complétement été détruit tout comme de nombreuses habitations mais miraculeusement, l'église Saint-Léger a été préservée. Ainsi, elle a conservé son architecture du XVIe siècle et sa façade et son portail ont gardé l'aspect qu'ils avaient avant le conflit.
De nos jours, elle fait partie des 19 édifices regroupés dans la paroisse Saint-Martin-l'Escaut dont la majorité des lieux de culte ont été reconstruits à l'entre-deux-guerres.